Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 AC174776.1-201ENSMUST00000221509 405 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 AC174776.2-201ENSMUST00000222561 405 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1202-201ENSMUST00000072057 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Ccser2-201ENSMUST00000067700 7334 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm45160-201ENSMUST00000207112 3099 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r26-201ENSMUST00000032238 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 AC154573.1-201ENSMUST00000225913 4659 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm11914-201ENSMUST00000117094 507 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Olfr723-201ENSMUST00000164157 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm29668-201ENSMUST00000187802 315 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm44389-201ENSMUST00000203795 182 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Olfr723-202ENSMUST00000206058 1078 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 AC117240.2-201ENSMUST00000220921 263 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Prl3d2-201ENSMUST00000080755 853 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm45517-201ENSMUST00000209973 2468 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r171-204ENSMUST00000226733 2918 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Olfr575-202ENSMUST00000213477 3512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm13386-201ENSMUST00000117677 124 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Nutf2-ps2-201ENSMUST00000179225 384 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm5891-201ENSMUST00000179493 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Khdrbs2-202ENSMUST00000185666 543 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm37632-201ENSMUST00000191811 1142 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm43580-201ENSMUST00000202892 284 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 AL606513.1-201ENSMUST00000225369 579 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 AC154239.2-201ENSMUST00000227859 233 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Olfr699-201ENSMUST00000065024 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 4930528J11Rik-201ENSMUST00000201689 3611 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1037-202ENSMUST00000213333 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Glyat-202ENSMUST00000119960 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Olfr128-202ENSMUST00000216440 3644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1487-205ENSMUST00000217061 4080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm37696-201ENSMUST00000194223 3349 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm14107-201ENSMUST00000117774 330 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r-ps99-201ENSMUST00000120067 766 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm11274-201ENSMUST00000146857 481 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Hmgb1-ps8-201ENSMUST00000181542 626 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Scgb2b12-201ENSMUST00000183195 511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ctdnep1Q3TP92 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms