Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Smg1-201ENSMUST00000032891 15557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Tbx20-201ENSMUST00000052946 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
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Rpusd2Q149F1 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
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Rpusd2Q149F1 Frem1-202ENSMUST00000107230 9690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 4921515E04Rik-203ENSMUST00000227364 2309 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
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Rpusd2Q149F1 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Luzp1-202ENSMUST00000063021 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Bsph2-201ENSMUST00000108526 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Ttc29-203ENSMUST00000117845 650 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
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Rpusd2Q149F1 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 4930401O12Rik-201ENSMUST00000153175 841 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
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Rpusd2Q149F1 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm45735-201ENSMUST00000212779 319 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
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Rpusd2Q149F1 AL589742.1-201ENSMUST00000226034 349 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
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Rpusd2Q149F1 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
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Rpusd2Q149F1 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
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Rpusd2Q149F1 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 AC153955.2-201ENSMUST00000216739 4129 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
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Rpusd2Q149F1 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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Rpusd2Q149F1 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
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Rpusd2Q149F1 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm23144-201ENSMUST00000180226 107 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm29228-201ENSMUST00000185489 418 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm44002-201ENSMUST00000205134 594 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm7786-201ENSMUST00000210494 436 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm29674-201ENSMUST00000218791 1139 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
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