Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Tspy-ps-202ENSMUST00000172304 321 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Vmn2r-ps122-201ENSMUST00000176687 906 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Gm15143-201ENSMUST00000178180 714 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Gm22711-202ENSMUST00000197029 135 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Gm36485-201ENSMUST00000214286 464 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Olfr603-202ENSMUST00000218246 1021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 AC140381.1-201ENSMUST00000219168 367 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 AC154618.2-201ENSMUST00000228299 452 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Olfr1018-201ENSMUST00000054201 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Olfr850-201ENSMUST00000077347 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Gm42484-201ENSMUST00000196075 2104 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Gm7974-201ENSMUST00000117154 408 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Rpl26-ps5-201ENSMUST00000122220 439 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Gm12971-201ENSMUST00000154720 511 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Gm8823-201ENSMUST00000193158 433 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Gm22897-201ENSMUST00000197860 128 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Fbxw15-203ENSMUST00000198397 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Olfr795-ps1-201ENSMUST00000205245 763 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Olfr790-204ENSMUST00000218901 1070 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Olfr790-201ENSMUST00000056002 1070 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Olfr773-201ENSMUST00000072976 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Olfr134-201ENSMUST00000074883 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Mrgprc2-ps-201ENSMUST00000188039 1516 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RxrbP28704 Hormad1-202ENSMUST00000090797 1511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms