Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Abca16-201ENSMUST00000056042 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 2810474O19Rik-208ENSMUST00000189837 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm24544-201ENSMUST00000103862 110 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm22204-201ENSMUST00000122654 327 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 4930570N18Rik-201ENSMUST00000159273 332 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm37272-201ENSMUST00000193401 488 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm38053-201ENSMUST00000193938 160 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm43700-201ENSMUST00000200967 316 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm19131-201ENSMUST00000203408 789 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm45081-201ENSMUST00000206281 572 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm44871-201ENSMUST00000207821 497 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Ssxb3-202ENSMUST00000089379 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Olfr1053-201ENSMUST00000099897 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm43844-201ENSMUST00000202926 5605 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Obox4-ps27-201ENSMUST00000179203 1362 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Synpr-207ENSMUST00000223583 3362 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 AC154184.1-201ENSMUST00000224375 1620 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm23273-201ENSMUST00000104058 135 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm24745-201ENSMUST00000157840 85 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm27805-201ENSMUST00000184513 79 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Hoxd10P28359 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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Hoxd10P28359 AC156801.2-201ENSMUST00000213613 487 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Ifngas1-201ENSMUST00000220034 1121 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 CT573086.3-201ENSMUST00000228762 594 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Olfr310-201ENSMUST00000081918 1082 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm42876-201ENSMUST00000196989 3215 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Olfr270-204ENSMUST00000215127 3145 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm43166-201ENSMUST00000202871 4379 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm23481-201ENSMUST00000104173 131 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm11914-201ENSMUST00000117094 507 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm1992-201ENSMUST00000161581 250 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 4930519F16Rik-206ENSMUST00000183292 800 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm28967-201ENSMUST00000187351 281 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms