Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm11168-202ENSMUST00000178077 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Zfp-ps-201ENSMUST00000185025 478 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm7646-201ENSMUST00000198590 1346 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Hspd1-ps2-201ENSMUST00000210003 1697 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm6171-201ENSMUST00000220760 645 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Olfr832-201ENSMUST00000060601 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Olfr1136-201ENSMUST00000077471 1067 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm44164-201ENSMUST00000203605 2561 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm3616-201ENSMUST00000174430 2514 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm3683-201ENSMUST00000175701 2513 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm24584-201ENSMUST00000157972 107 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm22286-201ENSMUST00000179708 107 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
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