Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Olfr1026-201ENSMUST00000056718 965 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Fpr-rs7-201ENSMUST00000095637 1017 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Vmn2r-ps11-201ENSMUST00000176568 2730 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Adgrg2-201ENSMUST00000112398 3418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Zfp950-204ENSMUST00000143264 4825 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm20139-202ENSMUST00000216041 3888 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Cnot6l-210ENSMUST00000155901 8564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Olfr653-202ENSMUST00000215585 4765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Olfr653-203ENSMUST00000217466 4786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Dmd-201ENSMUST00000113991 4438 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Btbd35f15-201ENSMUST00000186329 1917 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Olfr359-ps1-201ENSMUST00000115977 926 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm3362-201ENSMUST00000148102 466 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Trbv10-201ENSMUST00000168322 289 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm38166-201ENSMUST00000191660 471 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm45261-201ENSMUST00000211023 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm8158-201ENSMUST00000219220 465 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm8112-201ENSMUST00000219637 465 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Spp1-204ENSMUST00000112747 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Cyp7a1-201ENSMUST00000029905 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Dram2-201ENSMUST00000029507 1891 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Trav16d-dv11-201ENSMUST00000103606 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm16128-201ENSMUST00000117855 626 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Ggta1P23336 Gm14003-201ENSMUST00000130919 313 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms