Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm37223-202ENSMUST00000193592 490 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm17999-201ENSMUST00000211568 542 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Il1f8-201ENSMUST00000028363 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm13058-201ENSMUST00000117097 1435 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Glyat-202ENSMUST00000119960 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Olfr475-ps1-201ENSMUST00000117982 932 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm15168-201ENSMUST00000121057 316 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm14408-202ENSMUST00000126726 279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm14223-201ENSMUST00000146060 517 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm3025-201ENSMUST00000163454 489 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Samd15-201ENSMUST00000169669 1194 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm2878-201ENSMUST00000170173 486 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Mir6416-201ENSMUST00000183664 117 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm38046-201ENSMUST00000192733 550 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm9989-202ENSMUST00000193125 258 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Olfr165-203ENSMUST00000206410 1040 ntAPPRIS P2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm19096-201ENSMUST00000209705 766 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm7128-201ENSMUST00000211639 533 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Tmed10-203ENSMUST00000222585 619 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Olfr165-201ENSMUST00000052516 1040 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Olfr482-201ENSMUST00000081184 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm19619-201ENSMUST00000200707 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 AC154573.1-201ENSMUST00000225913 4659 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Vmn2r-ps128-201ENSMUST00000176367 2570 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Xiap-202ENSMUST00000055483 6374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm36931-201ENSMUST00000192997 4801 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 C4bp-201ENSMUST00000027657 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm22543-201ENSMUST00000104347 94 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm12520-201ENSMUST00000117493 316 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm25103-201ENSMUST00000122671 318 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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