Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Olfr1171-ps1-201ENSMUST00000118079 837 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm15660-201ENSMUST00000118997 478 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm13743-201ENSMUST00000121486 724 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm23591-201ENSMUST00000157663 286 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm16134-201ENSMUST00000161714 336 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gulp1-206ENSMUST00000162600 2798 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm8221-201ENSMUST00000178052 564 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm37341-201ENSMUST00000194680 371 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm2762-205ENSMUST00000202366 356 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Olfr490-202ENSMUST00000211345 1275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 AC115891.1-201ENSMUST00000215798 1755 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Uhrf1Q8VDF2 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms