Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 Igkv8-19-201ENSMUST00000103389 305 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 Gm44354-201ENSMUST00000196017 143 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 Gm44006-201ENSMUST00000204273 396 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 Gm17780-201ENSMUST00000207142 612 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 Gm45458-201ENSMUST00000209900 522 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 Gm30409-201ENSMUST00000223302 229 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 Sprr2e-201ENSMUST00000068399 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 Gm10042-201ENSMUST00000079884 78 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 0610010F05Rik-202ENSMUST00000093267 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 Olfr1043-202ENSMUST00000213886 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 Gm5924-201ENSMUST00000132554 871 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 Gm25386-201ENSMUST00000157814 288 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 Gm25748-201ENSMUST00000175487 70 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 1700063I16Rik-201ENSMUST00000194611 611 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 5930435M05Rik-201ENSMUST00000207572 3712 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 Gm11874-201ENSMUST00000117437 130 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 Rpl23a-ps14-201ENSMUST00000118777 424 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 Gm38270-201ENSMUST00000192721 407 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 Gm30034-201ENSMUST00000219589 248 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 Gm43871-201ENSMUST00000204931 1955 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 Dnase2b-201ENSMUST00000029836 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc18Q640L5 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Vmn2r17-201ENSMUST00000171841 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Gm9597-202ENSMUST00000227632 1387 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Mir551b-201ENSMUST00000102165 98 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Gm26075-201ENSMUST00000104062 121 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Snora64-201ENSMUST00000104521 134 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Gm11775-201ENSMUST00000136500 773 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Gm28471-201ENSMUST00000185994 615 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Olfr1225-201ENSMUST00000188861 1027 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Gm28153-201ENSMUST00000189853 629 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Gm37495-201ENSMUST00000194590 264 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Gm45507-201ENSMUST00000210611 519 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Gm46998-201ENSMUST00000221444 330 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 AC102603.1-201ENSMUST00000227481 584 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Slc5a12-202ENSMUST00000111026 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Gm43266-201ENSMUST00000201049 1771 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Gm11931-201ENSMUST00000121630 447 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Gm8498-201ENSMUST00000188227 974 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Gm37505-201ENSMUST00000195670 461 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Gm16892-201ENSMUST00000180999 1726 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Olfr1305-202ENSMUST00000213405 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Olfr235-204ENSMUST00000214613 2217 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Gm2182-201ENSMUST00000145243 663 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Gm25965-201ENSMUST00000157170 93 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Gm17546-201ENSMUST00000168960 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Gm43405-201ENSMUST00000198642 337 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Gm29793-201ENSMUST00000202874 460 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Gm9560-201ENSMUST00000205012 1201 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 Gm46190-201ENSMUST00000219650 427 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc18Q640L5 AC154358.1-201ENSMUST00000224871 218 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms