Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm12313-201ENSMUST00000121347 421 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm15521-201ENSMUST00000141752 835 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Fpr2-202ENSMUST00000149944 883 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm43617-201ENSMUST00000196418 606 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm42621-201ENSMUST00000198114 275 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm44853-201ENSMUST00000209070 250 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 AC124399.1-201ENSMUST00000218334 590 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 AC154851.2-201ENSMUST00000222172 644 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 AC165146.1-201ENSMUST00000223777 900 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Gm28047Q3US59 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm3089-201ENSMUST00000200804 1395 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm3302-201ENSMUST00000201462 1395 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 A530064N14Rik-201ENSMUST00000195338 1492 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Olfr1026-202ENSMUST00000217615 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm15087-201ENSMUST00000117465 1172 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm13815-201ENSMUST00000119963 412 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm12734-201ENSMUST00000120228 948 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm24517-201ENSMUST00000122560 107 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm13173-201ENSMUST00000151703 441 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm24729-201ENSMUST00000158225 137 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm2427-201ENSMUST00000189121 881 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Cycs-ps2-201ENSMUST00000197114 292 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm10282-201ENSMUST00000075602 1151 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Olfr1503-ps1-201ENSMUST00000076614 803 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm22043-201ENSMUST00000082993 158 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Mir16-2-201ENSMUST00000083672 95 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms