Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Gm44646-201ENSMUST00000205847 421 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Gm31897-201ENSMUST00000205924 340 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 1700011L03Rik-201ENSMUST00000210613 608 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Vmn2r-ps92-201ENSMUST00000220242 388 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 AC123534.1-201ENSMUST00000224060 656 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Mir129-2-201ENSMUST00000083577 90 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Gm45149-201ENSMUST00000206459 2172 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Btbd35f4-201ENSMUST00000105011 1491 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Olfr1016-203ENSMUST00000217410 2738 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Gm3020-201ENSMUST00000112801 450 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Gm13174-201ENSMUST00000126141 220 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Gm43768-201ENSMUST00000198380 1258 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Gm45083-201ENSMUST00000205216 712 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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PdgfraP26618 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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PdgfraP26618 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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PdgfraP26618 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Gm13173-201ENSMUST00000151703 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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PdgfraP26618 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 AC164567.4-201ENSMUST00000219708 483 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PdgfraP26618 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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