Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Rps27-206ENSMUST00000197361 329 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm3816-201ENSMUST00000209803 433 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm45379-201ENSMUST00000211772 549 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Olfr603-202ENSMUST00000218246 1021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 AC158803.3-201ENSMUST00000220024 211 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Platr25-208ENSMUST00000222602 939 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 AC121542.1-201ENSMUST00000227245 721 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Spata19-201ENSMUST00000034473 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm15168-201ENSMUST00000121057 316 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm14011-201ENSMUST00000145178 302 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm25665-201ENSMUST00000157695 110 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Vmn2r-ps121-201ENSMUST00000176230 802 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm38214-201ENSMUST00000192581 988 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Ighv3-4-201ENSMUST00000193408 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 1700126G02Rik-201ENSMUST00000204351 725 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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Atg3Q9CPX6 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 AC155236.1-201ENSMUST00000220591 923 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 AC154419.1-201ENSMUST00000227627 272 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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Atg3Q9CPX6 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Olfr1099-201ENSMUST00000099871 1031 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm11483-201ENSMUST00000119839 247 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm15735-201ENSMUST00000136187 514 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm13219-202ENSMUST00000152599 685 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm27387-201ENSMUST00000184583 116 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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