Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Gm9320-201ENSMUST00000184151 473 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm29492-201ENSMUST00000187124 457 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Trbv28-201ENSMUST00000192804 264 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Ighv3-4-201ENSMUST00000193408 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm43036-201ENSMUST00000200594 373 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm32453-201ENSMUST00000204183 456 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 AC153801.1-201ENSMUST00000217904 947 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 AC167013.2-202ENSMUST00000227035 333 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm25739-201ENSMUST00000082886 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Fat1-206ENSMUST00000215588 13938 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Olfr1104-203ENSMUST00000215972 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm37393-201ENSMUST00000195118 3870 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 A530064N14Rik-201ENSMUST00000195338 1492 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Olfr1341-202ENSMUST00000214131 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Olfr1406-203ENSMUST00000215878 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Fastkd2-201ENSMUST00000027103 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm5746-201ENSMUST00000183550 2200 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Olfr178-203ENSMUST00000215032 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Pcsk2os2-201ENSMUST00000153878 3370 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Trav16d-dv11-201ENSMUST00000103606 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm15012-201ENSMUST00000119176 106 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm11483-201ENSMUST00000119839 247 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm43968-201ENSMUST00000203388 389 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm45710-201ENSMUST00000212847 215 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 AC159263.3-201ENSMUST00000223434 460 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 AC113031.3-201ENSMUST00000226552 190 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Vmn1r215-201ENSMUST00000072972 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm23330-201ENSMUST00000082660 164 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Olfr1407-ps1-201ENSMUST00000085885 797 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Tsga10-203ENSMUST00000114902 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Vmn1r39-203ENSMUST00000227285 2245 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Mysm1-201ENSMUST00000075872 7420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Zfp458-204ENSMUST00000225772 3485 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Olfr1159-ps1-201ENSMUST00000117651 913 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sike1Q9CPR7 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms