Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Mrgprc2-ps-201ENSMUST00000188039 1516 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 AC155922.2-201ENSMUST00000220240 1458 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Igkv4-61-201ENSMUST00000103353 284 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm14007-201ENSMUST00000118288 210 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm9294-201ENSMUST00000165198 789 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm20663-201ENSMUST00000176647 474 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm26683-201ENSMUST00000181737 470 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm6680-201ENSMUST00000192789 950 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm43489-201ENSMUST00000196810 993 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm43245-201ENSMUST00000197603 468 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm43675-201ENSMUST00000199468 1184 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm43036-201ENSMUST00000200594 373 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm43100-201ENSMUST00000202985 674 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm4501-201ENSMUST00000207330 551 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm4528-201ENSMUST00000207905 551 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Olfr611-201ENSMUST00000078108 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Olfr381-201ENSMUST00000078358 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm12888-201ENSMUST00000097905 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Olfr1101-201ENSMUST00000099870 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxc12Q8K5B8 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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