Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Crisp2-201ENSMUST00000024724 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm12755-201ENSMUST00000122297 282 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 1700001D01Rik-201ENSMUST00000188654 565 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm6850-201ENSMUST00000210031 530 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm18644-201ENSMUST00000211458 815 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm30676-201ENSMUST00000214000 1165 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Olfr941-ps1-201ENSMUST00000215258 935 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm8681-201ENSMUST00000219115 618 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Olfr918-201ENSMUST00000055099 978 ntAPPRIS P2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Olfr339-201ENSMUST00000071437 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Obp1a-201ENSMUST00000088201 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Ssxb3-202ENSMUST00000089379 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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Dsg1bQ7TSF1 Fbxw14-201ENSMUST00000112041 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm26835-201ENSMUST00000181888 3274 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm14793-201ENSMUST00000118739 311 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Defa-ps12-201ENSMUST00000122353 193 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm22480-201ENSMUST00000122568 128 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm13180-201ENSMUST00000141222 440 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Tmem29-211ENSMUST00000163233 1256 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.6 ms