Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 4930503L19Rik-202ENSMUST00000211817 913 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Gm30034-201ENSMUST00000219589 248 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Gm7257-201ENSMUST00000041537 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Gm6065-201ENSMUST00000081336 492 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Gm37211-201ENSMUST00000193392 3433 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Gm38307-201ENSMUST00000195630 1840 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Btbd35f12-201ENSMUST00000178827 1908 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Ddx3y-201ENSMUST00000091190 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Gm11698-201ENSMUST00000117948 455 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Snrpe-201ENSMUST00000164096 669 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Gm44485-201ENSMUST00000199569 137 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 AC164437.2-201ENSMUST00000228915 797 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Olfr493-201ENSMUST00000080106 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Pbrm1-201ENSMUST00000022471 5871 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Gm15745-201ENSMUST00000119807 115 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Gm14710-201ENSMUST00000146082 1066 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Gm25965-201ENSMUST00000157170 93 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Gm25066-201ENSMUST00000158145 123 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Gm28471-201ENSMUST00000185994 615 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Gm6802-202ENSMUST00000186566 126 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Gm38201-201ENSMUST00000192143 387 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 2900037B21Rik-201ENSMUST00000194352 337 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Gm44354-201ENSMUST00000196017 143 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 C430039J01Rik-201ENSMUST00000205973 957 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Gm45727-201ENSMUST00000212886 572 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 AC154738.5-201ENSMUST00000227397 310 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 AC134577.1-201ENSMUST00000227572 295 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Mir26a-2-201ENSMUST00000083496 84 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Shank3Q4ACU6 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Igkv5-45-201ENSMUST00000103366 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm25376-201ENSMUST00000104340 133 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm24505-201ENSMUST00000157682 126 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm24998-201ENSMUST00000157908 89 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Serpinb10-203ENSMUST00000194951 1194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 4930558N11Rik-203ENSMUST00000211456 1180 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm30624-201ENSMUST00000220039 628 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 H2al1o-201ENSMUST00000079952 509 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 AC154677.1-201ENSMUST00000227636 2805 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Klhl13-204ENSMUST00000115317 3216 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Slc31a1-202ENSMUST00000122092 4154 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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