Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PtpreP49446 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PtpreP49446 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PtpreP49446 AC154598.1-201ENSMUST00000227079 347 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PtpreP49446 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PtpreP49446 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Olfr853-201ENSMUST00000058296 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PtpreP49446 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PtpreP49446 AC134596.1-201ENSMUST00000222016 1922 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm12693-201ENSMUST00000121965 483 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm21917-201ENSMUST00000177831 666 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm22851-201ENSMUST00000178741 94 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm4854-201ENSMUST00000185902 574 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm44523-201ENSMUST00000205616 417 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm45409-201ENSMUST00000211486 252 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm17990-201ENSMUST00000211728 553 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Olfr482-201ENSMUST00000081184 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Olfr1043-203ENSMUST00000213949 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms