Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gm5285-201ENSMUST00000193089 666 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Gm9989-202ENSMUST00000193125 258 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Ube2l3-ps1-201ENSMUST00000199777 436 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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H2-Q1O19441 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Vmn1r43-201ENSMUST00000089418 1069 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Gm31258-201ENSMUST00000194532 3297 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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H2-Q1O19441 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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H2-Q1O19441 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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H2-Q1O19441 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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H2-Q1O19441 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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H2-Q1O19441 Gm14991-201ENSMUST00000119913 598 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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H2-Q1O19441 AC174776.2-201ENSMUST00000222561 405 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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H2-Q1O19441 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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H2-Q1O19441 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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H2-Q1O19441 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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H2-Q1O19441 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Gm16026-202ENSMUST00000159695 772 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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H2-Q1O19441 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Gm17164-201ENSMUST00000169013 506 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
H2-Q1O19441 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 557.8 ms