Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrit3W8DXL4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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