Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z331

Krt6b, Keratin, type II cytoskeletal 6B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6bQ9Z331 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Krt6bQ9Z331 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt6bQ9Z331 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms