Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2T6

Krt85, Keratin, type II cuticular Hb5, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt85Q9Z2T6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Krt85Q9Z2T6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt85Q9Z2T6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms