Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd1Q9Z2E2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd1Q9Z2E2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms