Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms