Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn6Q9Z262 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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