Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms