Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z204

Hnrnpc, Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpcQ9Z204 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HnrnpcQ9Z204 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HnrnpcQ9Z204 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms