Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms