Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr4Q9Z1L2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms