Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z184

Padi3, Protein-arginine deiminase type-3, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi3Q9Z184 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Padi3Q9Z184 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms