Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z132

Rspo1, R-spondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo1Q9Z132 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo1Q9Z132 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rspo1Q9Z132 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms