Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skp2Q9Z0Z3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms