Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nup160Q9Z0W3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nup160Q9Z0W3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nup160Q9Z0W3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nup160Q9Z0W3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Nup160Q9Z0W3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Nup160Q9Z0W3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nup160Q9Z0W3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Nup160Q9Z0W3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nup160Q9Z0W3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nup160Q9Z0W3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nup160Q9Z0W3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nup160Q9Z0W3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nup160Q9Z0W3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nup160Q9Z0W3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nup160Q9Z0W3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nup160Q9Z0W3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nup160Q9Z0W3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nup160Q9Z0W3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nup160Q9Z0W3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nup160Q9Z0W3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms