Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0R6

Itsn2, Intersectin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itsn2Q9Z0R6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itsn2Q9Z0R6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itsn2Q9Z0R6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itsn2Q9Z0R6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itsn2Q9Z0R6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itsn2Q9Z0R6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itsn2Q9Z0R6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itsn2Q9Z0R6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Itsn2Q9Z0R6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itsn2Q9Z0R6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itsn2Q9Z0R6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itsn2Q9Z0R6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itsn2Q9Z0R6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itsn2Q9Z0R6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itsn2Q9Z0R6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itsn2Q9Z0R6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itsn2Q9Z0R6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itsn2Q9Z0R6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itsn2Q9Z0R6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Itsn2Q9Z0R6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itsn2Q9Z0R6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Itsn2Q9Z0R6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itsn2Q9Z0R6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Itsn2Q9Z0R6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itsn2Q9Z0R6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itsn2Q9Z0R6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Itsn2Q9Z0R6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms