Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I6

Slfn2, Schlafen 2, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn2Q9Z0I6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slfn2Q9Z0I6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slfn2Q9Z0I6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms