Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AireQ9Z0E3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AireQ9Z0E3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AireQ9Z0E3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AireQ9Z0E3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AireQ9Z0E3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AireQ9Z0E3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AireQ9Z0E3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AireQ9Z0E3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AireQ9Z0E3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AireQ9Z0E3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AireQ9Z0E3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AireQ9Z0E3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AireQ9Z0E3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AireQ9Z0E3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AireQ9Z0E3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AireQ9Z0E3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AireQ9Z0E3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AireQ9Z0E3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AireQ9Z0E3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AireQ9Z0E3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AireQ9Z0E3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AireQ9Z0E3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AireQ9Z0E3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AireQ9Z0E3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AireQ9Z0E3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AireQ9Z0E3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AireQ9Z0E3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AireQ9Z0E3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AireQ9Z0E3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AireQ9Z0E3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AireQ9Z0E3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AireQ9Z0E3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AireQ9Z0E3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms