Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pacsin2Q9WVE8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms