Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stxbp4Q9WV89 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stxbp4Q9WV89 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms