Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Stub1Q9WUD1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms