Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrf1Q9WU00 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms