Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrkraQ9WTX2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkraQ9WTX2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkraQ9WTX2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkraQ9WTX2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkraQ9WTX2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkraQ9WTX2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkraQ9WTX2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkraQ9WTX2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkraQ9WTX2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkraQ9WTX2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkraQ9WTX2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkraQ9WTX2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkraQ9WTX2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkraQ9WTX2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkraQ9WTX2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkraQ9WTX2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkraQ9WTX2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkraQ9WTX2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkraQ9WTX2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkraQ9WTX2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkraQ9WTX2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkraQ9WTX2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkraQ9WTX2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkraQ9WTX2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkraQ9WTX2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkraQ9WTX2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkraQ9WTX2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkraQ9WTX2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms