Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR0

Mmp16, Matrix metalloproteinase-16, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp16Q9WTR0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp16Q9WTR0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms