Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Y5

Hic1, Hypermethylated in cancer 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hic1Q9R1Y5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hic1Q9R1Y5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hic1Q9R1Y5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms