Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim3Q9R1R2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms