Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SrpxQ9R0M3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SrpxQ9R0M3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SrpxQ9R0M3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SrpxQ9R0M3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SrpxQ9R0M3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrpxQ9R0M3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SrpxQ9R0M3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SrpxQ9R0M3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SrpxQ9R0M3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SrpxQ9R0M3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrpxQ9R0M3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrpxQ9R0M3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrpxQ9R0M3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrpxQ9R0M3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SrpxQ9R0M3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrpxQ9R0M3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrpxQ9R0M3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrpxQ9R0M3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrpxQ9R0M3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrpxQ9R0M3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrpxQ9R0M3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrpxQ9R0M3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrpxQ9R0M3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrpxQ9R0M3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrpxQ9R0M3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms