Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zeb2Q9R0G7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms