Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Plod3Q9R0E1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Plod3Q9R0E1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms