Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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Gpc6Q9R087 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Gpc6Q9R087 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
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Gpc6Q9R087 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Gpc6Q9R087 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc6Q9R087 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
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Gpc6Q9R087 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Gpc6Q9R087 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Gpc6Q9R087 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Gpc6Q9R087 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Gpc6Q9R087 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Gpc6Q9R087 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpc6Q9R087 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms