Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nubp2Q9R061 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms