Protein–RNA interactions for Protein: Q9R060

Nubp1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp1Q9R060 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nubp1Q9R060 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms