Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AmfrQ9R049 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
AmfrQ9R049 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms